Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'5-6-Internal Loop pdb1ykq1B.n17-28 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Source: [PDB-id:chain] | 1ykq:B (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | CRYSTAL STRUCTURE OF DIELS-ALDER RIBOZYME | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | DIELS-ALDER RIBOZYME | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 3.50 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (11, 35), (17, 28) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _UGCCA_-_AAUACU_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
3: C1'-exo, 6: C2'-exo, 7: C2'-exo, 12: O4'-endo, 13: C1'-endo, 14: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |