Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '15-Segment pdb1y6910.i2313-2329 | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 1y69:0 (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||
| Source: Information | RRF DOMAIN I IN COMPLEX WITH THE 50S RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS | ||||||||||||||||||
| Source: Compound | 23S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 3.33 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||
| Position | (2313, 2329) | ||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _AUCAACGGAUAAAAG_ | ||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
5: C4'-exo, 8: C2'-exo | ||||||||||||||||||
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Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
2: syn, 10: syn | ||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||