Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '7-Hairpin pdb1y261X.e47-55 | |||||||||||||||||||||
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| Source: [PDB-id:chain] | 1y26:X (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||
| Source: Information | A-RIBOSWITCH-ADENINE COMPLEX | ||||||||||||||||||||
| Source: Compound | VIBRIO VULNIFICUS A-RIBOSWITCH | ||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 2.10 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||
| Position | (47, 55) | ||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _CCUUAAA_ | ||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
4: C2'-endo, 5: C2'-endo, 6: C2'-exo, 7: C2'-endo | ||||||||||||||||||||
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Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
6: syn, 7: syn | ||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||