Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'9-Hairpin pdb1xpf1B.e7-17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 1xpf:B (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | HIV-1 SUBTYPE A GENOMIC RNA DIMERIZATION INITIATION SITE | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 5'- | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 2.30 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (7, 17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _AGGUGCACA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
1: C2'-endo, 3: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
3: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |