Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '3-3-Internal Loop pdb1x8wFD.n120-162 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 1x8w:D (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | STRUCTURE OF THE TETRAHYMENA RIBOZYME: BASE TRIPLE SANDWICH AND METAL ION AT THE ACTIVE SITE | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound |
TETRAHYMENA RIBOZYME RNA FLIPPED INTERNAL |
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| Source: Resolution | 3.80 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (121, 161), (125, 157) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _GCA_-_CAA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
6: C2'-exo, 10: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
2: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||