Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'4-5-Internal Loop pdb1x8wFA.n32-100 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 1x8w:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | STRUCTURE OF THE TETRAHYMENA RIBOZYME: BASE TRIPLE SANDWICH AND METAL ION AT THE ACTIVE SITE | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound |
TETRAHYMENA RIBOZYME RNA FLIPPED INTERNAL |
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Source: Resolution | 3.80 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (26, 105), (32, 100) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _ACAU_-_AACAG_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: C2'-exo, 11: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
9: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |