Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '1-6-Internal Loop pdb1x8w1D.n36-97 | |||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 1x8w:D (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | STRUCTURE OF THE TETRAHYMENA RIBOZYME: BASE TRIPLE SANDWICH AND METAL ION AT THE ACTIVE SITE | ||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | TETRAHYMENA RIBOZYME RNA | ||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 3.80 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (39, 94), (41, 87) | ||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _U_-_AAUAAG_ | ||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
3: C2'-exo, 4: C4'-exo, 10: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
|
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||