Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '15-Segment pdb1x8w1D.i162-178 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 1x8w:D (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | STRUCTURE OF THE TETRAHYMENA RIBOZYME: BASE TRIPLE SANDWICH AND METAL ION AT THE ACTIVE SITE | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | TETRAHYMENA RIBOZYME RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 3.80 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (162, 178) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _ACACAGACUAGAUGU_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
5: C4'-exo, 12: C2'-exo, 13: C4'-exo, 15: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
3: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||