Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'1-6-Internal Loop pdb1x8w1A.n41-87 | |||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 1x8w:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | STRUCTURE OF THE TETRAHYMENA RIBOZYME: BASE TRIPLE SANDWICH AND METAL ION AT THE ACTIVE SITE | ||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | TETRAHYMENA RIBOZYME RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 3.80 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (39, 94), (41, 87) | ||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _U_-_AAUAAG_ | ||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: C2'-exo, 4: O4'-endo, 7: C4'-exo, 10: C4'-exo, 11: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
9: syn, 10: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |