Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'5-4-Internal Loop pdb1x8w1A.n21-110 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 1x8w:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | STRUCTURE OF THE TETRAHYMENA RIBOZYME: BASE TRIPLE SANDWICH AND METAL ION AT THE ACTIVE SITE | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | TETRAHYMENA RIBOZYME RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 3.80 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (26, 105), (32, 100) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _AACAG_-_ACAU_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
3: C2'-exo, 12: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
5: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |