Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '2-3-Internal Loop pdb1vspFw.n1222-1272 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 1vsp:w (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | INTERACTIONS AND DYNAMICS OF THE SHINE-DALGARNO HELIX IN THE 70S RIBOSOME. THIS FILE, 1VSP, CONTAINS THE 50S RIBOSOME SUBUNIT. 30S RIBOSOME SUBUNIT IS IN THE FILE 2QNH | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound |
23S LARGE SUBUNIT RIBOSOMAL RNA FLIPPED INTERNAL |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 3.83 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (1226, 1268), (1230, 1265) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _AA_-_GAU_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
3: C4'-exo, 5: C2'-exo, 6: C4'-exo, 7: C4'-exo, 8: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
3: syn, 7: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||