Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'3-2-Internal Loop pdb1vsaFw.n2445-2486 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 1vsa:w (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | CRYSTAL STRUCTURE OF A 70S RIBOSOME-TRNA COMPLEX REVEALS FUNCTIONAL INTERACTIONS AND REARRANGEMENTS. THIS FILE, 1VSA, CONTAINS THE 50S RIBOSOME SUBUNIT. 30S RIBOSOME SUBUNIT IS IN THE FILE 2OW8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound |
23S LARGE SUBUNIT RIBOSOMAL RNA FLIPPED INTERNAL |
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Source: Resolution | 3.71 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (2447, 2484), (2450, 2480) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _UUU_-_GA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
3: C4'-exo, 5: C3'-exo, 7: C2'-exo, 8: C3'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
8: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |