Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '3-2-Internal Loop pdb1vsa1w.n1222-1272 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Source: [PDB-id:chain] | 1vsa:w (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | CRYSTAL STRUCTURE OF A 70S RIBOSOME-TRNA COMPLEX REVEALS FUNCTIONAL INTERACTIONS AND REARRANGEMENTS. THIS FILE, 1VSA, CONTAINS THE 50S RIBOSOME SUBUNIT. 30S RIBOSOME SUBUNIT IS IN THE FILE 2OW8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | 23S LARGE SUBUNIT RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 3.71 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (1226, 1268), (1230, 1265) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _GAU_-_AA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
1: C2'-exo, 3: C4'-exo, 5: C2'-exo, 7: C4'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
3: syn, 7: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||