Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '14-Hairpin pdb1vsa1w.e343-358 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Source: [PDB-id:chain] | 1vsa:w (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | CRYSTAL STRUCTURE OF A 70S RIBOSOME-TRNA COMPLEX REVEALS FUNCTIONAL INTERACTIONS AND REARRANGEMENTS. THIS FILE, 1VSA, CONTAINS THE 50S RIBOSOME SUBUNIT. 30S RIBOSOME SUBUNIT IS IN THE FILE 2OW8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | 23S LARGE SUBUNIT RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 3.71 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (343, 358) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _CAGAGAGGGUGAAA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: C2'-exo, 6: C4'-exo, 8: C2'-exo, 9: C2'-exo, 10: C2'-exo, 11: C2'-exo, 12: C4'-exo, 13: C4'-exo, 16: C4'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
6: syn, 13: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||