Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '11-Hairpin pdb1vsa1w.e2254-2266 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 1vsa:w (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | CRYSTAL STRUCTURE OF A 70S RIBOSOME-TRNA COMPLEX REVEALS FUNCTIONAL INTERACTIONS AND REARRANGEMENTS. THIS FILE, 1VSA, CONTAINS THE 50S RIBOSOME SUBUNIT. 30S RIBOSOME SUBUNIT IS IN THE FILE 2OW8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | 23S LARGE SUBUNIT RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 3.71 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (2254, 2266) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _UAAAAGGUAAC_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
3: C2'-endo, 7: C2'-exo, 12: C3'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
4: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||