Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'14-Hairpin pdb1vqp10.e317-332 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 1vqp:0 (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | THE STRUCTURE OF THE TRANSITION STATE ANALOGUE "RAP" BOUND TO THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT OF HALOARCULA MARISMORTUI | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 23S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 2.25 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (317, 332) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _GAUACAGGGUGACA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
4: C2'-endo, 5: C2'-endo, 6: C2'-endo, 12: C2'-endo, 13: C2'-endo, 14: C1'-exo, 15: C2'-endo, 16: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
6: syn, 13: syn, 15: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |