Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'5-Hairpin pdb1vqo10.e128-134 | |||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 1vqo:0 (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||
Source: Information | THE STRUCTURE OF CCPMN BOUND TO THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT HALOARCULA MARISMORTUI | ||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 23S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 2.20 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||
Position | (128, 134) | ||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _UUCGC_ | ||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
4: C2'-endo, 5: C4'-exo, 6: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
3: syn, 5: syn, 6: syn | ||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |