Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '10-Segment pdb1vqm10.i1318-1329 | |||||||||||||||||||||||||
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| Source: [PDB-id:chain] | 1vqm:0 (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | THE STRUCTURE OF THE TRANSITION STATE ANALOGUE "DAN" BOUND TO THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT OF HALOARCULA MARISMORTUI | ||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | 23S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 2.30 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||
| Position | (1318, 1329) | ||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _UGACGAAAAU_ | ||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
3: C1'-exo, 6: C2'-endo, 7: C2'-endo, 8: C2'-endo, 9: C1'-exo, 10: C4'-exo, 11: C4'-exo, 12: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
7: syn, 8: syn, 9: syn | ||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||