Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'9-3-Internal Loop pdb1vqkF0.n1498-1633 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 1vqk:0 (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | THE STRUCTURE OF CCDA-PHE-CAP-BIO BOUND TO THE A SITE OF THE RIBOSOMAL SUBUNIT OF HALOARCULA MARISMORTUI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound |
23S RIBOSOMAL RNA FLIPPED INTERNAL |
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Source: Resolution | 2.30 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (1500, 1631), (1504, 1621) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _CCAUGAAAA_-_GAC_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
7: C2'-endo, 8: C2'-endo, 9: C2'-endo, 10: C4'-exo, 13: C2'-endo, 14: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
6: syn, 13: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |