Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '3-3-Internal Loop pdb1vq4F0.n659-671 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 1vq4:0 (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | THE STRUCTURE OF THE TRANSITION STATE ANALOGUE "DAA" BOUND TO THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT OF HALOARCULA MARISMORTUI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound |
23S RIBOSOMAL RNA FLIPPED INTERNAL |
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| Source: Resolution | 2.70 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (655, 675), (659, 671) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _GGA_-_UAA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
3: C3'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
3: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||