Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '2-1-Internal Loop pdb1u1y1R.n1-17 | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 1u1y:R (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | CRYSTAL STRUCTURE OF A COMPLEX BETWEEN WT BACTERIOPHAGE MS2 COAT PROTEIN AND AN F5 APTAMER RNA STEMLOOP WITH 2AMINOPURINE SUBSTITUTED AT THE-10 POSITION | ||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | 5'-R(*CP*CP*GP*GP*(2PR) | ||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 2.85 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||
| Position | (3, 15), (6, 13) | ||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _GG_-_A_ | ||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
None | ||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
3: syn | ||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||