Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '5-Hairpin pdb1sy41A.e9-15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 1sy4:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | REFINED SOLUTION STRUCTURE OF THE S. CEREVISIAE U6 INTRAMOLECULAR STEM LOOP (ISL) RNA USING RESIDUAL DIPOLAR COUPLINGS (RDCS) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | U6 INTRAMOLECULAR STEM-LOOP RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | NOT APPLICABLE. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (9, 15) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _GCAUA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: C2'-exo, 3: C1'-endo, 4: C2'-endo, 5: C4'-exo, 6: C4'-endo, 7: C4'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||