Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'4-Hairpin pdb1slp1A.e7-12 | |||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 1slp:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||
Source: Information | FIRST STEM LOOP OF THE SL1 RNA FROM CAENORHABDITIS ELEGANS, NMR, 16 STRUCTURES | ||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | RNA (5'- | ||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | NOT APPLICABLE. | ||||||||||||||||||||||||
Position | (7, 12) | ||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _AGUU_ | ||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
3: C2'-endo, 4: C1'-exo, 5: C4'-exo | ||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
3: syn | ||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |