Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'2-7-Internal Loop pdb1s1iF3.n1594-1751 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Source: [PDB-id:chain] | 1s1i:3 (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | STRUCTURE OF THE RIBOSOMAL 80S-EEF2-SORDARIN COMPLEX FROM YEAST OBTAINED BY DOCKING ATOMIC MODELS FOR RNA AND PROTEIN COMPONENTS INTO A 11.7 A CRYO-EM MAP. THIS FILE, 1S1I, CONTAINS 60S SUBUNIT. THE 40S RIBOSOMAL SUBUNIT IS IN FILE 1S1H. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound |
5.8S/25S RIBOSOMAL RNAILS: REPRESENTED BY THE ANALOGOUS MOLECULE OF H. FLIPPED INTERNAL |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 1.70 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (1601, 1744), (1609, 1741) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _GA_-_AGUGAAA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: C2'-endo, 7: C2'-endo, 8: C2'-endo, 10: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
9: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |