Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '5-3-Internal Loop pdb1s1iF3.n1535-1570 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 1s1i:3 (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | STRUCTURE OF THE RIBOSOMAL 80S-EEF2-SORDARIN COMPLEX FROM YEAST OBTAINED BY DOCKING ATOMIC MODELS FOR RNA AND PROTEIN COMPONENTS INTO A 11.7 A CRYO-EM MAP. THIS FILE, 1S1I, CONTAINS 60S SUBUNIT. THE 40S RIBOSOMAL SUBUNIT IS IN FILE 1S1H. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound |
5.8S/25S RIBOSOMAL RNAILS: REPRESENTED BY THE ANALOGOUS MOLECULE OF H. FLIPPED INTERNAL |
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| Source: Resolution | 1.70 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (1536, 1569), (1540, 1563) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _GAAAU_-_UAA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: C2'-endo, 4: C2'-endo, 5: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
|
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|
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||