Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'3-7-Internal Loop pdb1s1i13.n2856-2989 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 1s1i:3 (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | STRUCTURE OF THE RIBOSOMAL 80S-EEF2-SORDARIN COMPLEX FROM YEAST OBTAINED BY DOCKING ATOMIC MODELS FOR RNA AND PROTEIN COMPONENTS INTO A 11.7 A CRYO-EM MAP. THIS FILE, 1S1I, CONTAINS 60S SUBUNIT. THE 40S RIBOSOMAL SUBUNIT IS IN FILE 1S1H. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 5.8S/25S RIBOSOMAL RNAILS: REPRESENTED BY THE ANALOGOUS MOLECULE OF H. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 1.70 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (2852, 2997), (2856, 2989) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _UGA_-_GAAAAGA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
3: C2'-endo, 8: C2'-endo, 9: C2'-endo, 10: C2'-endo, 11: C4'-exo, 12: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |