Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'7-Hairpin pdb1r3e1C.e5-13 | |||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 1r3e:C (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | CRYSTAL STRUCTURE OF TRNA PSEUDOURIDINE SYNTHASE TRUB AND ITS RNA COMPLEX: RNA-PROTEIN RECOGNITION THROUGH A COMBINATION OF RIGID DOCKING AND INDUCED FIT | ||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 5'-R(*CP*UP*GP*UP*GP*UP*(FHU) | ||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 2.10 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (5, 13) | ||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _UUCGAUC_ | ||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: O4'-endo, 3: C3'-exo, 4: C1'-exo, 5: C1'-exo, 7: C2'-exo, 8: O4'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
5: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |