Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '8-5-Internal Loop pdb1qvgF0.n756-896 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 1qvg:0 (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | STRUCTURE OF CCA OLIGONUCLEOTIDE BOUND TO THE TRNA BINDING SITES OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT OF HALOARCULA MARISMORTUI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound |
23S RIBOSOMAL RNA FLIPPED INTERNAL |
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| Source: Resolution | 2.90 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (757, 895), (763, 886) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _CAACAGCU_-_CGAAU_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
4: C1'-exo, 8: C2'-endo, 9: C2'-endo, 14: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
14: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||