Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '7-Segment pdb1qvf10.i1490-1498 | |||||||||||||||||||||||||
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| Source: [PDB-id:chain] | 1qvf:0 (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | STRUCTURE OF A DEACYLATED TRNA MINIHELIX BOUND TO THE E SITE OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT OF HALOARCULA MARISMORTUI | ||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | 23S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 3.10 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||
| Position | (1490, 1498) | ||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _AGUGAAA_ | ||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
4: C1'-exo, 6: C1'-exo, 7: C1'-exo | ||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
4: syn, 5: syn, 7: syn | ||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||