Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '4-1-Internal Loop pdb1q8nFA.n10-23 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 1q8n:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | SOLUTION STRUCTURE OF THE MALACHITE GREEN RNA BINDING APTAMER | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound |
RNA APTAMER FLIPPED INTERNAL |
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| Source: Resolution | NOT APPLICABLE. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (8, 28), (10, 23) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _GUAA_-_A_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
3: C2'-exo, 4: C2'-exo, 5: C4'-exo, 7: O4'-endo, 8: C2'-endo, 9: C1'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
5: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||