Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'9-4-Internal Loop pdb1pnyF0.n1386-1542 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Source: [PDB-id:chain] | 1pny:0 (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | CRYSTAL STRUCTURE OF THE WILD TYPE RIBOSOME FROM E. COLI, 50S SUBUNIT OF 70S RIBOSOME. THIS FILE, 1PNY, CONTAINS ONLY MOLECULES OF THE 50S RIBOSOMAL SUBUNIT. THE 30S SUBUNIT IS IN THE PDB FILE 1PNX. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound |
23S RIBOSOMAL RNA FLIPPED INTERNAL |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 9.50 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (1388, 1540), (1393, 1530) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _CAAGAAAAG_-_GGAC_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |