Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'3-6-Internal Loop pdb1pnuF0.n2069-2101 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 1pnu:0 (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | CRYSTAL STRUCTURE OF A STREPTOMYCIN DEPENDENT RIBOSOME FROM ESCHERICHIA COLI, 50S SUBUNIT OF 70S RIBOSOME. THIS FILE, 1PNU, CONTAINS ONLY MOLECULES OF THE 50S RIBOSOMAL SUBUNIT. THE 30S SUBUNIT, MRNA, P-SITE TRNA, AND A-SITE TRNA ARE IN THE PDB FILE 1PNS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound |
23S RIBOSOMAL RNA FLIPPED INTERNAL |
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Source: Resolution | 8.70 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (2071, 2099), (2078, 2095) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _GGA_-_GAAGAA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
1: C2'-exo, 2: C2'-endo, 9: C2'-endo, 10: C2'-endo, 11: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
11: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |