Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '5-4-Internal Loop pdb1pnu19.n28-54 | |||||||||||||||||||||||||
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| Source: [PDB-id:chain] | 1pnu:9 (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | CRYSTAL STRUCTURE OF A STREPTOMYCIN DEPENDENT RIBOSOME FROM ESCHERICHIA COLI, 50S SUBUNIT OF 70S RIBOSOME. THIS FILE, 1PNU, CONTAINS ONLY MOLECULES OF THE 50S RIBOSOMAL SUBUNIT. THE 30S SUBUNIT, MRNA, P-SITE TRNA, AND A-SITE TRNA ARE IN THE PDB FILE 1PNS. | ||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | 5S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 8.70 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||
| Position | (22, 59), (28, 54) | ||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _GAACC_-_GAAA_ | ||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
None | ||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||