Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '2-7-Internal Loop pdb1p5oFA.n7-72 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 1p5o:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | SOLUTION STRUCTURE OF HCV IRES DOMAIN II | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound |
77-MER FLIPPED INTERNAL |
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| Source: Resolution | NOT APPLICABLE. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (8, 71), (16, 68) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _CC_-_GGAACUA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
4: C4'-exo, 7: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
|
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|
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
|
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||