Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '7-Hairpin pdb1p5n1A.e13-21 | |||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 1p5n:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | SOLUTION STRUCTURE OF HCV IRES DOMAIN IIB | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | 34-MER | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | NOT APPLICABLE. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (13, 21) | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _UAGCCAU_ | ||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: C4'-exo, 3: C4'-exo, 4: C2'-endo, 5: C4'-exo, 6: O4'-endo, 7: C2'-endo, 8: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||