Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '3-1-Internal Loop pdb1oswFA.n1-22 | |||||||||||||||||||||||||
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| Source: [PDB-id:chain] | 1osw:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | THE STEM OF SL1 RNA IN HIV-1: STRUCTURE AND NUCLEOCAPSID PROTEIN BINDING FOR A 1X3 INTERNAL LOOP | ||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound |
5'- FLIPPED INTERNAL |
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| Source: Resolution | NOT APPLICABLE. | ||||||||||||||||||||||||
| Position | (4, 19), (6, 15) | ||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _AGG_-_G_ | ||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: C2'-endo, 6: C2'-endo, 8: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
2: syn | ||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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|
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||