Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '1-3-Internal Loop pdb1osw1A.n6-15 | |||||||||||||||||||||||||
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| Source: [PDB-id:chain] | 1osw:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | THE STEM OF SL1 RNA IN HIV-1: STRUCTURE AND NUCLEOCAPSID PROTEIN BINDING FOR A 1X3 INTERNAL LOOP | ||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | 5'- | ||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | NOT APPLICABLE. | ||||||||||||||||||||||||
| Position | (4, 19), (6, 15) | ||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _G_-_AGG_ | ||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
1: C2'-exo, 3: C2'-endo, 7: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
7: syn | ||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||