Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '4-Segment pdb1ooa1C.i5-10 | |||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 1ooa:C (&rarr PDB) | ||||||||||||||||
| Source: Information | CRYSTAL STRUCTURE OF NF-KB(P50)2 COMPLEXED TO A HIGH- AFFINITY RNA APTAMER | ||||||||||||||||
| Source: Compound | RNA APTAMER | ||||||||||||||||
| Source: Resolution | 2.45 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||
| Position | (5, 10) | ||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _UUGA_ | ||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
None | ||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
None | ||||||||||||||||
| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||