Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'4-7-Internal Loop pdb1n361A.n667-678 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 1n36:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNIT IN THE PRESENCE OF CRYSTALLOGRAPHICALLY DISORDERED CODON AND NEAR-COGNATE TRANSFER RNA ANTICODON STEM-LOOP MISMATCHED AT THE SECOND CODON POSITION | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 16S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 3.65 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (662, 686), (667, 678) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _AGUA_-_GCAGAUA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
4: C2'-endo, 5: C4'-exo, 6: C2'-exo, 9: C4'-exo, 10: C2'-endo, 11: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |