Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '19-Segment pdb1n361A.i1462-1482 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 1n36:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNIT IN THE PRESENCE OF CRYSTALLOGRAPHICALLY DISORDERED CODON AND NEAR-COGNATE TRANSFER RNA ANTICODON STEM-LOOP MISMATCHED AT THE SECOND CODON POSITION | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | 16S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 3.65 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (1462, 1482) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _CGAAGUCGUAACAAGGUAG_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
5: C4'-exo, 10: C2'-endo, 14: C2'-endo, 15: C2'-endo, 16: C2'-endo, 18: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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|
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||