Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'11-Segment pdb1n341A.i1273-1285 | |||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 1n34:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNIT IN THE PRESENCE OF CODON AND CRYSTALLOGRAPHICALLY DISORDERED NEAR-COGNATE TRANSFER RNA ANTICODON STEM-LOOP MISMATCHED AT THE FIRST CODON POSITION | ||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 16S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 3.80 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||
Position | (1273, 1285) | ||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _CCAGUUCGGAU_ | ||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: C2'-endo, 3: C2'-endo, 4: C4'-exo, 5: C2'-endo, 6: C4'-exo, 7: C2'-endo, 10: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
4: syn, 5: syn, 7: syn | ||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |