Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '16-Hairpin pdb1n341A.e486-503 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Source: [PDB-id:chain] | 1n34:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNIT IN THE PRESENCE OF CODON AND CRYSTALLOGRAPHICALLY DISORDERED NEAR-COGNATE TRANSFER RNA ANTICODON STEM-LOOP MISMATCHED AT THE FIRST CODON POSITION | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | 16S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 3.80 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (486, 503) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _CAACUCCGUGCCAGCA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: C2'-endo, 5: C2'-endo, 11: C2'-endo, 12: C4'-exo, 13: C4'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
2: syn, 4: syn, 5: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||