Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '5-5-Internal Loop pdb1n33FA.n1218-1273 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 1n33:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNIT BOUND TO CODON AND NEAR-COGNATE TRANSFER RNA ANTICODON STEM-LOOP MISMATCHED AT THE SECOND CODON POSITION AT THE A SITE WITH PAROMOMYCIN | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound |
16S RIBOSOMAL RNA FLIPPED INTERNAL |
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| Source: Resolution | 3.35 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (1224, 1267), (1230, 1261) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _AAAAA_-_ACAAA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
12: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
5: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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|
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
|
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||