Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'2-6-1-1-3-Multiloop pdb1n331A.m52-347 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 1n33:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNIT BOUND TO CODON AND NEAR-COGNATE TRANSFER RNA ANTICODON STEM-LOOP MISMATCHED AT THE SECOND CODON POSITION AT THE A SITE WITH PAROMOMYCIN | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 16S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 3.35 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (54, 345), (57, 95), (102, 305), (307, 328), (330, 341) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _AA_-_GGACGG_-_A_-_A_-_GCA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
3: C2'-endo, 8: C2'-endo, 14: C2'-endo, 20: C4'-exo, 22: C1'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
7: syn, 8: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |