Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '9-Segment pdb1m5v1E.i54-64 | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 1m5v:E (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | TRANSITION STATE STABILIZATION BY A CATALYTIC RNA | ||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | RNA HAIRPIN RIBOZYME | ||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 2.40 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||
| Position | (54, 64) | ||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _GUAUAUUAC_ | ||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: C3'-exo, 3: C3'-exo, 4: C3'-exo, 5: C2'-endo, 7: C3'-exo, 8: C3'-exo | ||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
4: syn | ||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
|
||||||||||||||||||||||||
|
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
None | ||||||||||||||||||||||||
| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
||||||||||||||||||||||||
| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||
| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||