Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '3-1-Internal Loop pdb1m5lFA.n9-32 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 1m5l:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | STRUCTURE OF WILD-TYPE AND MUTANT INTERNAL LOOPS FROM THE SL-1 DOMAIN OF THE HIV-1 PACKAGING SIGNAL | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound |
MODIFIED HIV-1 PACKAGING SIGNAL STEM-LOOP 1 RNA FLIPPED INTERNAL |
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| Source: Resolution | NOT APPLICABLE. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (12, 29), (14, 25) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _GGA_-_G_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
1: C4'-exo, 2: C2'-endo, 3: C2'-endo, 4: C1'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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|
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||