Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'2-4-Internal Loop pdb1m5lFA.n1-38 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 1m5l:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | STRUCTURE OF WILD-TYPE AND MUTANT INTERNAL LOOPS FROM THE SL-1 DOMAIN OF THE HIV-1 PACKAGING SIGNAL | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound |
MODIFIED HIV-1 PACKAGING SIGNAL STEM-LOOP 1 RNA FLIPPED INTERNAL |
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Source: Resolution | NOT APPLICABLE. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (4, 35), (9, 32) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _GG_-_AGGA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: C2'-endo, 6: C2'-exo, 7: C2'-endo, 8: C3'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
|
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |