Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '6-Hairpin pdb1kpy1A.e5-12 | |||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 1kpy:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||
| Source: Information | PEMV-1 P1-P2 FRAMESHIFTING PSEUDOKNOT, 15 LOWEST ENERGY STRUCTURES | ||||||||||||||||||||
| Source: Compound | P1-P2 FRAMESHIFTING PSEUDOKNOT | ||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | NOT APPLICABLE. | ||||||||||||||||||||
| Position | (5, 12) | ||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _UCGACU_ | ||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
1: C2'-exo, 3: C2'-exo, 4: C1'-endo, 5: C2'-exo, 6: C4'-exo, 7: C4'-endo | ||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||