Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '2-4-Internal Loop pdb1kp7FA.n6-25 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 1kp7:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | CONSERVED RNA STRUCTURE WITHIN THE HCV IRES EIF3 BINDING SITE | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound |
HEPATITIS C VIRUS INTERNAL RIBOSOME ENTRY SITE FLIPPED INTERNAL |
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| Source: Resolution | NOT APPLICABLE. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (7, 24), (12, 21) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _AC_-_AAUG_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
1: C2'-exo, 6: C2'-exo, 7: C2'-endo, 8: C3'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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|
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||