Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'5-5-Internal Loop pdb1kd1FA.n1884-1897 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 1kd1:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | CO-CRYSTAL STRUCTURE OF SPIRAMYCIN BOUND TO THE 50S RIBOSOMAL SUBUNIT OF HALOARCULA MARISMORTUI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound |
23S RRNA FLIPPED INTERNAL |
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Source: Resolution | 3.00 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (1878, 1903), (1884, 1897) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _ACGAA_-_GAACA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
4: C4'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
4: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |